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CT由于X线球管和探测器是环绕人体某一部位旋转，所以只能做人体横断面的扫描成像，而MRI可做横断矢状冠状和任意切面的成像MRI由不同的扫描序列可形成各种图像，如T1加权像T2加权像质子密度像等，还有水成像水抑制。